MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 35176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	TGA	2	6	117	122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809974
2	NC_013156	TTG	2	6	135	140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809974
3	NC_013156	CTT	2	6	192	197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809974
4	NC_013156	AT	3	6	233	238	50 %	50 %	0 %	0 %	256809974
5	NC_013156	GA	3	6	300	305	50 %	0 %	50 %	0 %	256809974
6	NC_013156	GCA	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809974
7	NC_013156	AATA	2	8	390	397	75 %	25 %	0 %	0 %	256809974
8	NC_013156	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
9	NC_013156	TCAA	2	8	609	616	50 %	25 %	0 %	25 %	256809975
10	NC_013156	GCT	2	6	684	689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809975
11	NC_013156	GCATCT	2	12	699	710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256809975
12	NC_013156	CTC	2	6	755	760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
13	NC_013156	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
14	NC_013156	AAC	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
15	NC_013156	T	6	6	839	844	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
16	NC_013156	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
17	NC_013156	TGTT	2	8	865	872	0 %	75 %	25 %	0 %	256809975
18	NC_013156	ACA	2	6	900	905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
19	NC_013156	CAT	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809975
20	NC_013156	CTG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809975
21	NC_013156	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809975
22	NC_013156	CAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809975
23	NC_013156	ACA	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
24	NC_013156	CAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809975
25	NC_013156	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809975
26	NC_013156	T	6	6	1204	1209	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
27	NC_013156	ATA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
28	NC_013156	T	6	6	1224	1229	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
29	NC_013156	T	6	6	1236	1241	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
30	NC_013156	TCC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
31	NC_013156	T	6	6	1287	1292	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
32	NC_013156	CCAA	2	8	1293	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	256809975
33	NC_013156	T	6	6	1305	1310	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
34	NC_013156	TCT	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
35	NC_013156	ACT	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809975
36	NC_013156	TAA	2	6	1426	1431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
37	NC_013156	T	6	6	1433	1438	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
38	NC_013156	T	7	7	1477	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
39	NC_013156	CTT	3	9	1486	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
40	NC_013156	TCC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809975
41	NC_013156	T	6	6	1517	1522	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
42	NC_013156	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
43	NC_013156	CTT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
44	NC_013156	T	6	6	1589	1594	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
45	NC_013156	AAT	2	6	1596	1601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809975
46	NC_013156	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	256809975
47	NC_013156	TCT	2	6	1632	1637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
48	NC_013156	TTC	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809975
49	NC_013156	A	6	6	1814	1819	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
50	NC_013156	AT	3	6	1905	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	256809976
51	NC_013156	T	6	6	1918	1923	0 %	100 %	0 %	0 %	256809976
52	NC_013156	CTTG	2	8	1954	1961	0 %	50 %	25 %	25 %	256809976
53	NC_013156	A	7	7	1998	2004	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
54	NC_013156	A	6	6	2015	2020	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
55	NC_013156	GTT	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809976
56	NC_013156	T	7	7	2041	2047	0 %	100 %	0 %	0 %	256809976
57	NC_013156	AAT	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809976
58	NC_013156	GA	3	6	2058	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	256809976
59	NC_013156	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809976
60	NC_013156	GAT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809976
61	NC_013156	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
62	NC_013156	A	7	7	2158	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
63	NC_013156	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
64	NC_013156	TAAA	2	8	2211	2218	75 %	25 %	0 %	0 %	256809976
65	NC_013156	T	6	6	2227	2232	0 %	100 %	0 %	0 %	256809976
66	NC_013156	A	7	7	2235	2241	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
67	NC_013156	TAT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809976
68	NC_013156	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809976
69	NC_013156	TGA	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809976
70	NC_013156	GA	4	8	2347	2354	50 %	0 %	50 %	0 %	256809976
71	NC_013156	GAA	2	6	2392	2397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809976
72	NC_013156	CAT	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809976
73	NC_013156	A	6	6	2458	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
74	NC_013156	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809976
75	NC_013156	A	6	6	2513	2518	100 %	0 %	0 %	0 %	256809976
76	NC_013156	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	256809977
77	NC_013156	T	6	6	3343	3348	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
78	NC_013156	T	6	6	3394	3399	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
79	NC_013156	CTG	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809978
80	NC_013156	TA	3	6	3447	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	256809978
81	NC_013156	GCT	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809978
82	NC_013156	CTT	2	6	3478	3483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
83	NC_013156	TAT	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
84	NC_013156	AT	3	6	3657	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	256809978
85	NC_013156	T	6	6	3684	3689	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
86	NC_013156	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
87	NC_013156	CAA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809978
88	NC_013156	ATTTC	2	10	3836	3845	20 %	60 %	0 %	20 %	256809978
89	NC_013156	CTT	2	6	3947	3952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
90	NC_013156	CTC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
91	NC_013156	CTT	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
92	NC_013156	TTAC	2	8	4039	4046	25 %	50 %	0 %	25 %	256809978
93	NC_013156	AAC	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809978
94	NC_013156	CTA	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809978
95	NC_013156	ATT	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
96	NC_013156	GAG	2	6	4208	4213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809978
97	NC_013156	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
98	NC_013156	CT	3	6	4288	4293	0 %	50 %	0 %	50 %	256809978
99	NC_013156	CATCTA	2	12	4307	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809978
100	NC_013156	TCC	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
101	NC_013156	TCC	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
102	NC_013156	CTAA	2	8	4459	4466	50 %	25 %	0 %	25 %	256809978
103	NC_013156	CCT	3	9	4502	4510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
104	NC_013156	TCC	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809978
105	NC_013156	CTT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
106	NC_013156	TCT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809978
107	NC_013156	AGT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809978
108	NC_013156	AT	3	6	4619	4624	50 %	50 %	0 %	0 %	256809978
109	NC_013156	CTTT	2	8	4634	4641	0 %	75 %	0 %	25 %	256809978
110	NC_013156	TC	3	6	4715	4720	0 %	50 %	0 %	50 %	256809978
111	NC_013156	GTT	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809978
112	NC_013156	ATT	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809978
113	NC_013156	AAT	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
114	NC_013156	AAT	2	6	4920	4925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
115	NC_013156	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
116	NC_013156	TAA	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809978
117	NC_013156	GAT	2	6	5058	5063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809978
118	NC_013156	TC	3	6	5074	5079	0 %	50 %	0 %	50 %	256809978
119	NC_013156	T	6	6	5145	5150	0 %	100 %	0 %	0 %	256809978
120	NC_013156	TTTAA	2	10	5219	5228	40 %	60 %	0 %	0 %	256809979
121	NC_013156	CTT	2	6	5262	5267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
122	NC_013156	TCT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
123	NC_013156	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809979
124	NC_013156	TCA	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
125	NC_013156	CTA	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
126	NC_013156	T	6	6	5330	5335	0 %	100 %	0 %	0 %	256809979
127	NC_013156	TCT	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
128	NC_013156	TCA	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
129	NC_013156	CTT	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
130	NC_013156	ACA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809979
131	NC_013156	CAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
132	NC_013156	CTT	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809979
133	NC_013156	CCT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
134	NC_013156	AGC	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809979
135	NC_013156	ACA	2	6	5926	5931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809979
136	NC_013156	TG	3	6	5943	5948	0 %	50 %	50 %	0 %	256809979
137	NC_013156	TC	3	6	6007	6012	0 %	50 %	0 %	50 %	256809979
138	NC_013156	TCA	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
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143	NC_013156	TCC	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809979
144	NC_013156	TCA	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809979
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